library reorganisation

MDD/deconvolve.c

@@ -3,6 +3,9 @@
 #include <assert.h>
 #include <math.h>
 #include <string.h>
+#ifdef MKL
+#include<mkl_cblas.h>
+#endif
 
 typedef struct { /* complex number */
 	float r,i;

Make_include_template

@@ -8,6 +8,12 @@
 # the current directory (in vi ":r!pwd")
 ROOT=/Users/jan/src/OpenSource
 
+#############################################################################
+# Some convenient abbreviations
+B = $(ROOT)/bin
+I = $(ROOT)/include
+L = $(ROOT)/lib
+
 ########################################################################
 # C compiler; change this only if you are using a different C-compiler
 
@@ -87,18 +93,16 @@ BLAS = ${MKLROOT}/lib/libmkl_intel_lp64.a ${MKLROOT}/lib/libmkl_sequential.a ${M
 #AMD ACML 4.4.0
 #AMDROOT = /home/thorbcke/amdsdk/v1.0/acml/open64_64
 #OPTC += -DACML440 -I$(AMDROOT)/include
-#LIBSM = -L$(AMDROOT)/lib -lacml -lfortran -lffio -lrt -lm
+#BLAS = -L$(AMDROOT)/lib -lacml -lfortran -lffio -lrt -lm
 #Intel MKL
 MKLROOT=/opt/intel/mkl/
 OPTC += -DMKL -I$(MKLROOT)/include
 FFT = ${MKLROOT}/lib/libmkl_intel_lp64.a ${MKLROOT}/lib/libmkl_sequential.a ${MKLROOT}/lib/libmkl_core.a -lpthread -lm -ldl
 
-#############################################################################
-# Some convenient abbreviations
+#LIBARIES
+LIBS= -L$L -lgenfft $(FFT) $(BLAS)
+
 
-B = $(ROOT)/bin
-I = $(ROOT)/include
-L = $(ROOT)/lib
 
 ########################################################################
 # standard CFLAGS

corrvir/Makefile

@@ -3,7 +3,7 @@
 include ../Make_include
 
 ALLINC  = -I.
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm
 #OPTC += -g -O0 -m64
 #OPTC = -g -O0 -fno-omit-frame-pointer
 

fdelmodc/Makefile

@@ -5,8 +5,7 @@ include ../Make_include
 ########################################################################
 # define general include and system library
 ALLINC  = -I.
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
-#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm -lc
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #OPTC = -g -Wall -fsignaling-nans -O0 -fopenmp
 #OPTC += -fopenmp -Waddress
 #OPTC := $(subst -O3 -ffast-math, -O1 -g ,$(OPTC))

fdemmodc/Makefile

@@ -5,7 +5,7 @@ include ../Make_include
 ########################################################################
 # define general include and system library
 ALLINC  = -I.
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #LIBS    += -L$L -lgenfft -lm -lc
 #OPTC = -g -Wall -fsignaling-nans -O0
 #OPTC += -fopenmp -Waddress

marchenko/Makefile

@@ -2,7 +2,7 @@
 
 include ../Make_include
 
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #OPTC += -g -O0 -Wall 
 
 #ALL: fmute marchenko marchenko2

raytime/Makefile

@@ -5,7 +5,7 @@ include ../Make_include
 ########################################################################
 # define general include and system library
 ALLINC  = -I.
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #LIBS    += -L$L -lgenfft -lm -lc
 #OPTC = -g -Wall -fsignaling-nans -O0
 #OPTC += -fopenmp -Waddress

raytime3d/Makefile

@@ -5,7 +5,7 @@ include ../Make_include
 ########################################################################
 # define general include and system library
 ALLINC  = -I.
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #LIBS    += -L$L -lgenfft -lm -lc
 #OPTC = -g -Wall -fsignaling-nans -O0
 #OPTC += -fopenmp -Waddress

utils/Makefile

@@ -2,7 +2,7 @@
 
 include ../Make_include
 
-LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
+#LIBS    += -L$L -lgenfft -lm $(LIBSM)
 #OPTC += -openmp 
 #OPTC += -g -O0